Berberys zwyczajny jest ceniony w medycynie naturalnej Europy i Azji. W celach leczniczych używa się zarówno owoców, korzenia, jak i liści. Owoce są w pełni jadalne. Z dojrzałych można przygotować domowe dżemy, konfitury i syropy, rozgrzewające nalewki, soki, a także dodawać je zimą do herbat. Owoce najlepiej zbierać po pierwszych przymrozkach, tracą wówczas swoją cierpkość.