Przekazanie książek odbyło się w Domu rekolekcyjno-formacyjnym Wyższego Metropolitarnego Seminarium Duchownego na Bielanach, w miejscu, w którym niegdyś mieściła się biblioteka seminaryjna.
22 sierpnia 1960 r. w 67 miejscach jednocześnie, do bibliotek kościelnych wkroczyli przedstawiciele Urzędu Kontroli Prasy, Urzędu do Spraw Wyznań, a także Milicji Obywatelskiej. Podczas trwającej dwa dni akcji zabrano prawdopodobnie 12 tys. książek. Z zasady konfiskowano dzieła, które w tytule miały słowa: komunizm, bolszewizm, socjalizm, kwestia robotnicza. Konfiskowano nawet te książki, które nie powinny budzić żadnych zastrzeżeń np. niektóre encykliki papieskie, książki: Stolica Apostolska a Rosja, Podstawy etyki i prawa oraz wiele różnych dzieł teologicznych i ascetycznych. Ponadto zabierano książki, w których Kościół występował przeciwko pornografii i demoralizacji, a także te, które dotyczyły działalności społecznej Kościoła i Akcji Katolickiej.
W ramach zmian ustrojowych, rozpoczętych po 1989 r. dokonywano reorganizacji różnych pionów administracji państwowej, w tym także Urzędu do Spraw Wyznań. W wyniku tych przemian w 1997 r. Departament Wyznań MSWiA przekazał Kościołowi 1814 książek, które zostały skonfiskowane w 1960 r. Księgozbiór ten został przekazany ks. Krzysztofowi Gonetowi, obecnemu dyrektorowi Biura do Spraw Rozwoju i Komputeryzacji Federacji Bibliotek Kościelnych FIDES, z poleceniem, aby przekazał je prawowitym właścicielom.
Prace nad przygotowaniem książek do zwrotu trwały dość długo. Niejednokrotnie znaki właściwe (pieczątki) były nieczytelne i niejednoznaczne. - Dzięki temu, że zachowały się dane archiwalne mogliśmy wiedzieć dokładnie ile książek zostało zabranych - zaznaczył ks. Krzysztof Gonet. Przykładowo: Biblioteka WSD w Warszawie, która straciła 723 książki, odzyska 102 pozycje. Biblioteka Pisarzy SJ straciła 265 książek, odzyska 50 pozycji, Biblioteka we Włocławku straciła 870 książek, odzyska 29 pozycji. Nie wiadomo dokładnie ile książek straciły pozostałe biblioteki, gdyż nie zachowały się żadne archiwalia albo archiwów tych jeszcze nie sprawdzono. Spis wszystkich książek zwróconych Kościołowi w 1997 r. można znaleźć na stronie internetowej: www.fides.org.pl/1960.html.
Jak dotąd książki zostały zwrócone tylko 22 bibliotekom. Wszystkich poszkodowanych było 67. Niektóre z nich już nie istnieją, dlatego ważne jest ustalenie, kto jest właściwym spadkobiercą nieistniejących bibliotek czy instytutów. Jeśli nie uda się tego ustalić, książki znajdą swoje miejsce w Bibliotece Seminarium Duchownego na Krakowskim Przedmieściu, gdzie będzie można z nich korzystać. Każda z nich jest dokładnie opisana: do jakiej biblioteki należała i jaką ma przeszłość.
Zwrócone książki to zaledwie 15% skonfiskowanych przed laty publikacji. Co się stało z pozostałymi, tego na razie nikt nie wie. Niemniej jednak jest to „niewymierna strata duchowa” dla wielu przyszłych pokoleń.