Najbardziej papieskim miejscem bez wątpienia jest pl. Piłsudskiego (dawniej Zwycięstwa). To na nim Jan Paweł II odprawił pierwszą Mszę św. na ojczystej ziemi w 1979 r. A także w 1999 r., kiedy wyniósł na ołtarze 108 męczenników II wojny światowej i poświęcił kamień węgielny pod budowę Świątyni Opatrzności Bożej.
Najczęściej odwiedzanym przez Papieża miejscem była katedra św. Jana Chrzciciela. Jan Paweł II modlił się w niej za każdym razem, gdy tylko na trasie pielgrzymki znajdowała się Warszawa, czyli w 1979, 1983, 1987, 1991 i 1999 r. Do doskonale znanych papieskich miejsc w stolicy trzeba też zaliczyć lotnisko na Okęciu, gdzie wielokrotnie odbywały się oficjalne ceremonie powitalne. Ojciec Święty kojarzy nam się również z kościołem akademickim św. Anny, Domem Arcybiskupów Warszawskich oraz Nuncjaturą Apostolską przy al. Szucha. Papież kilkukrotnie bywał w Zamku Królewskim, Belwederze, a także w domu Sióstr Urszulanek na Powiślu. Odwiedził Sekretariat Konferencji Episkopatu Polski, poświęcił nowy budynek Biblioteki Uniwersyteckiej.
Ojciec Święty odcisnął piętno również w tych częściach Warszawy, które mniej się z nim kojarzą. Wystarczy tu wspomnieć nieistniejący już stadion X-lecia albo pl. Defilad przed pałacem Kultury i Nauki. Podczas Mszy papieskich modliliśmy się w parku Agrykola oraz w kościele Wszystkich Świętych przy pl. Grzybowskim. Wielu warszawiaków już nie pamięta, że Jan Paweł II odprawił Mszę św. również w praskiej bazylice Najświętszego Serca Jezusa przy ul. Kawęczyńskiej. W 1999 r. spotkał się z wiernymi nowej wówczas diecezji warszawsko-praskiej przed katedrą św. Floriana oraz ze służbami mundurowymi przy katedrze polowej WP. Lista papieskich kościołów jest jednak dłuższa. Podczas pielgrzymek Ojciec Święty odwiedził sanktuarium Matki Bożej Łaskawej Ojców Jezuitów, kościół Ojców Kapucynów przy ul. Miodowej, bazylikę Świętego Krzyża przy Karkowskim Przedmieściu, poświęcił kościół środowisk twórczych przy pl. Teatralnym. Modlił się zarówno w cerkwi greckokatolickiej przy ul. Miodowej, jak i podczas nabożeństwa ekumenicznego w luterańskim kościele Świętej Trójcy.
Papież w 1999 r. był w Sejmie, gdzie spotykał się z parlamentarzystami, oraz w Teatrze Wielkim, gdzie przemawiał do ludzi kultury. Pielgrzymki kojarzą się nam również z tłumem wiernych wiwatujących wzdłuż przejazdów papamobile. Mamy więc całe papieskie ulice. Najbardziej znany jest Trakt Królewski i al. Żwirki i Wigury. Podczas przejazdów papamobile Jan Paweł II wielokrotnie zatrzymywał się, aby wskazać ważne dla Polaków miejsca. W ten sposób dawał nam swoistą lekcję patriotyzmu i historii.
Lista miejsc pamięci rozpoczyna się oczywiście przed Grobem Nieznanego Żołnierza, ale Papież był także na Pawiaku, przed pomnikiem Bohaterów Getta, pomnikami Armii Krajowej i Polskiego Państwa Podziemnego oraz Poległych i Pomordowanych na Wschodzie. Historycznym wydarzeniem była modlitwa przed grobem współczesnego męczennika ks. Jerzego Popiełuszki w 1987 r.
Aby lekcja papieskiej historii była pełna, powinniśmy udać się także poza granice Warszawy. Ojciec Święty oddał hołd bohaterom Bitwy Warszawskiej z 1920 r. w Radzyminie, a także modlił się w Niepokalanowie, gdzie przypomniał heroiczną wiarę i męczeństwo św. Maksymiliana Kolbego.