Ogromna rzesza młodych krakowian przeszła w niedzielę 3 kwietnia wieczorem w spontanicznie zorganizowanym Marszu Milczenia dla uczczenia Jana Pawła II.
Inicjatywa zrodziła się wśród studentów krakowskich uczelni. Młodzi ludzie przekazali sobie informację o marszu przy pomocy SMS-ów i stron internetowych. Studenci i mieszkańcy Krakowa, trzymając w dłoniach znicze i świece, przeszli w milczeniu przez Rynek Główny, Trakt Królewski, obok Wawelu, aż do papieskiego głazu na krakowskich Błoniach. Niektórzy śpiewali ulubioną przez Ojca Świętego Barkę. Studenci prosili wykładowców o przełożenie zajęć, by mogli uczestniczyć w marszu. W 24 godziny po śmierci Ojca Świętego okna krakowskich akademików zapaliły się znakiem krzyża. „Chodzi o to, by uczcić pamięć Papieża, ale także o to, by nie pozostawać samemu w tym osieroceniu po Jego odejściu” - tłumaczyli.
7 kwietnia, w przeddzień pogrzebu Jana Pawła II, odbył się w Krakowie drugi Biały Marsz Wdzięczności za pontyfikat. Marsz zakończył się na krakowskich Błoniach Mszą św., odprawioną przy głazie papieskim w intencji zmarłego Papieża.