Wcześniej na tym miejscu stały kolejno trzy kościoły. Nie ma się co dziwić – parafia w Przegini liczy sobie już siedem wieków. W XIV wieku powstał tu drewniany kościół, zastąpiony po 330 latach świątynią murowaną, wzniesioną z fundacji Michała Zebrzydowskiego (to jego dziadkowi, Mikołajowi, zawdzięczamy słynną Kalwarię z sanktuarium pasyjno-maryjnym i klasztorem Ojców Bernardynów). Obecny kościół, gruntownie przebudowany na początku XX wieku, został uroczyście poświęcony przez biskupa kieleckiego Augustyna Łosińskiego.