Kolorystyka nowej kaplicy dostosowana jest do palety barw panujących w całym wnętrzu bazyliki. Podłoga posiada odpowiednią posadzkę, a na sklepieniu znajduje się polichromia, która za pomocą obrazów biblijnych przybliża przesłanie wypływające z ostatniej encykliki Jana Pawła II Ecclesia de Eucharistia (Kościół rodzi się z Eucharystii). Autorką polichromii jest artystka z Krakowa, Agnieszka Grochalowa, która wespół ze swoją przyjaciółką wykonywała także polichromię w głównym kościele. Na razie wnętrze kaplicy nie wypełniają pamiątki po Janie Pawle II, podobnie jak i pusta pozostaje wnęka na obraz. To jednak już w niedalekiej przyszłości ma się zmienić. Jak mówi ks. Jan Gil, proboszcz bazyliki, na pewno do kaplicy przeniesiony zostanie fotel Jana Pawła II, który obecnie znajduje się przy prezbiterium. Wnętrze mogą także wypełnić wota i inne oznaki czci do Ojca Świętego. Póki co, daleka od rozstrzygnięcia pozostaje sprawa obrazu, który zawiśnie w centralnym punkcie kaplicy. - Z jednej strony mamy obraz Papieża, na którym widzimy go, jako myśliciela. Wisi on w głównej nawie obok głównego ołtarza. I myśmy się z nim związali. Jednocześnie ks. Nowobilski, który jest opiekunem artystycznym, sugeruje, że dobrze byłoby zrobić ładniejszy. Jest taka artystka, p. Śliwa, która wykonała już kilka bardzo udanych portretów Papieża i zastanawiamy się, czy aby nie „uderzyć” do niej. Zależałoby nam na takim wizerunku Jana Pawła II, który u człowieka „budzi zaufanie i wywołuje nadzieję” - mówi ks. Jan Gil. I choć jeszcze nie wiadomo, czy w ogóle zostanie zamówiony nowy obraz, pewne jest, że światło jakie będzie na niego padać, przechodzić będzie przez specjalne witraże. W myśl pomysłu Proboszcza pomogą one oddać aurę świetlanej postaci Jana Pawła II.
Prace nad papieską kaplicą rozpoczęły się w ubiegłym roku. Miejsce na nią wygospodarowano z pomieszczenia przy chórze, w którym jeszcze do niedawna znajdowała się stara dmuchawa do organów. Za 7 tys. zł sprowadzono z Włoch nową, małogabarytową dmuchawę, którą można było bezpośrednio zamocować do instrumentu. To spowodowało, że droga do realizacji pomysłu na stworzenie papieskiej kaplicy w bazylice Ofiarowania NMP stanęła otworem. Teraz, kiedy coraz bliżej jest końca nadania kaplicy ostatecznego kształtu, można na bieżąco śledzić zmiany w jej wnętrzu. Jest ona cały czas otwarta dla pielgrzymów. Jej pobłogosławienia dokonał Benedykt XVI podczas swej wizyty w Wadowicach 27 maja tego roku.